Cianobacteriile sunt cele mai vechi specii existente în lume. Se crede că aceste bacterii sunt cea mai veche formă de viață cunoscută a Pământului. Stromatoliții fosilizați - un tip de rocă stratificată alcătuită din covoare microbiene de microorganisme - datând de acum peste 3,5 milioane de ani conțin dovezi ale activității cianobacteriilor.